医院污水处理设备主要处理的医院污水有：

　　每天使用在不同病人身上的不同的药物，这些药物在使用之后就需要及时的处理;

　　医院里面的消毒液，还有一些大量的病菌都是污水产生的源泉，所以在医院的时候我们都可以看见，医务人员是不会将含有药物的药瓶以及其他相关的药物进行乱扔乱放的，因为他们知道，这样的问题如果不经过处理后果非常的严重。

　　医院污水处理设备除了上述的病毒需要处理外，还有一些含有有机物以及无机物的东西，这些病毒不经过处理对生活，对病人的危害是相当的大的。